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捕获人的BCR转录本完整V(D)J 可变区
SMART-Seq Human BCR (with UMIs)
· 完整的BCR分析—支持分析重链(IgG, IgM, IgA, IgD, IgE) 和轻链 (IgK, IgL)
· 灵活的样本起始条件—支持PBMCs (10 ng - 1 μg)、B细胞(1-100 ng)、脾脏或骨髓(10 ng),全血(100 ng)来源的RNA起始
· 添加UMI建库,获得更可靠测序数据—SMARTer Oligo上引入UMI,用于校正测序错误和PCR偏差
· 灵活的测序平台选择—可自由选择V(D)J全长分析,或只分析CDR3
 
■ 产品说明
SMART-Seq Human BCR (with UMIs) 提供了一种灵敏、准确、优化的BCR NGS库分析方法。该试剂盒整合SMART(Switching Mechanism at 5' end of RNA Template)全长cDNA合成技术与5’RACE技术,可捕获重链(IgG/M/D/A/E) 和轻链 (IgK/L)基因完整的V(D)J可变区,用于后续NGS分析。
该试剂盒支持不同起始量的RNA(RIN≥8,取决于样本类型)起始,均可获得高品质的测序文库。比如外周血单核细胞(PBMC)纯化的10 ng-1 μg的总RNA, B细胞纯化的1-100 ng的总RNA,脾脏或骨髓10 ng的总RNA,或者全血来源的100 ng的总RNA。
该试剂盒还包括特别的分子条形码(UMI),可以消除PCR错误或duplication以及测序偏向,从而确保获得更准确和可靠的结果。此外,搭配使用的双端特殊index(UDI,Unique Dual Index),可以提供完整的从样品到文库构建的实验体验。
 
■ 流程概要
 
■ 不同起始量克隆型检测数据
图1 不同的RNA起始量,均能获得高灵敏度和重复性的克隆型检测数据
 
从10 ng、100 ng和1,000 ng人PBMC细胞总RNA中,利用本试剂盒制备BCR分析IgA、IgD、IgG、IgM、IgK和IgL文库。使用Cogent NGS Immune Profiler Software分析测序数据。
 
关联产品:Unique Dual Index Kit
 
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页面更新:2024-01-17 15:54:21

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