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SMARTer PrepX试剂盒——简单、自动化的NGS文库制备(For Illumina Sequencing)
· 一次性预分装联排管,不同试剂间使用颜色标记区分
· 在有效范围内,无论起始量高低,均能生成重复性好、质量高的NGS文库
· 良好应对各种实验样本通量
 
■ 应用领域
· 一致的DNA-seq、RNA-seq、ChIP-seq文库制备无缝式解决方案
· Illumina测序平台测序文库自动化制备,无需大量繁琐的手动操作
 
■ 产品说明
SMARTer PrepX系列试剂盒提供了Illumina测序文库制备必需的每一种试剂。相关试剂已预分装在单次使用的联排管中,并使用不同的颜色区分标记,可以轻松完成SMARTer Apollo系统操作台面布置工作。SMARTer PrepX系列试剂盒和相关程序脚本的设计融入了灵活性,以适应不同样本通量的需求。设置过程十分简单:只需按照图形用户界面的相关提示将试剂放到指定位置,布置好操作台面,点击“Run”即可,无需人员看管。
 
■ 性能表现
样本起始量和样本质量对于任何测序应用来说都需要着重注意。在实验流程中使用过多的样品或得到的产量很低意味着浪费材料、拖延实验进度、糟糕的实验结果、下游测序实验难以开展。SMARTer PrepX试剂盒配合相关程序脚本通过生成一致的、高质量的NGS文库解决这些困扰。在有效的范围内,不再担心样本起始浓度的影响(Table I)。
 
  Table I. 可靠的测序覆盖度和表现
  Input amount   10 ng   100 ng
  Adapter reads (%)   0   0
  Confidently mapped read (%)   96.61   96.43
  Repetitive reads (%)   1.84   1.80
  Low-quality reads (%)   0   0
 
上述实验,使用SMARTer Apollo系统,搭配SMARTer PrepX DNA Library Kit,从10 ng和100 ng E. coli基因组DNA中完成高质量文库制备。获得的文库使用Illumina MiSeq®平台进行测序(2 × 150 bp)。
 
■ 上样量要求
每一种SMARTer PrepX试剂与一个对应不同通量的脚本相兼容,有最小样本上样量的需求。相关总结见Table II。
 
  Table II. SMARTer PrepX kits与SMARTer Apollo预编程脚本不同组合所需样本量
Code No. SMARTer Apollo试剂盒 兼容脚本 脚本通量 最小上样量/样本
640101*  SMARTer PrepX DNA Library Kit PrepX ILMN 8 1-8  1 ng DNA
640102*  SMARTer PrepX DNA Library Kit  PrepX ILMN 32i 4-32  1 ng DNA
 
* Code No.640101提供足够运行24个样本的试剂量,每批次多达8个样本。Code No. 640102提供足够运行96个样本的试剂量,每批次多达32个样本。
 
 
 
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页面更新:2024-01-31 16:08:49

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